Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms