Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPOP42166 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPOP42166 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPOP42166 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPOP42166 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms