Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBX2P40425 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBX2P40425 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PBX2P40425 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PBX2P40425 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PBX2P40425 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PBX2P40425 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBX2P40425 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PBX2P40425 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PBX2P40425 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PBX2P40425 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms