Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PPARGP37231 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPARGP37231 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PPARGP37231 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PPARGP37231 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms