Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms