Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTKP29376 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTKP29376 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTKP29376 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTKP29376 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTKP29376 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTKP29376 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTKP29376 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTKP29376 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTKP29376 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTKP29376 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTKP29376 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTKP29376 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTKP29376 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms