Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms