Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR2AP28223 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms