Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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