Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF1P22415 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USF1P22415 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USF1P22415 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USF1P22415 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USF1P22415 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF1P22415 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USF1P22415 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USF1P22415 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF1P22415 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF1P22415 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF1P22415 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF1P22415 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF1P22415 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF1P22415 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF1P22415 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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