Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms