Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRHP20396 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRHP20396 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRHP20396 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRHP20396 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRHP20396 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRHP20396 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRHP20396 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRHP20396 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRHP20396 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRHP20396 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRHP20396 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRHP20396 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms