Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms