Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms