Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB3P14651 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms