Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms