Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms