Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPBP07988 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms