Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBL3O95164 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBL3O95164 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBL3O95164 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBL3O95164 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBL3O95164 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBL3O95164 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBL3O95164 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBL3O95164 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBL3O95164 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBL3O95164 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBL3O95164 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBL3O95164 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBL3O95164 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBL3O95164 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBL3O95164 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBL3O95164 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBL3O95164 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms