Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG13O75143 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG13O75143 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG13O75143 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG13O75143 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG13O75143 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG13O75143 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG13O75143 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG13O75143 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG13O75143 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms