Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRD4O60885 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRD4O60885 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRD4O60885 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRD4O60885 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRD4O60885 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD4O60885 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD4O60885 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD4O60885 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD4O60885 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD4O60885 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms