Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms