Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms