Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC3O60481 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms