Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX5O60225 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX5O60225 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX5O60225 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms