Protein–RNA interactions for Protein: O43916

CHST1, Carbohydrate sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST1O43916 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHST1O43916 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHST1O43916 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHST1O43916 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHST1O43916 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST1O43916 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CHST1O43916 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST1O43916 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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