Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXTL3O43909 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXTL3O43909 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms