Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNQ2O43526 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms