Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COCHO43405 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COCHO43405 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COCHO43405 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COCHO43405 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COCHO43405 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COCHO43405 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COCHO43405 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COCHO43405 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COCHO43405 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COCHO43405 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COCHO43405 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms