Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR1CO15160 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms