Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms