Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLGNO14967 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLGNO14967 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLGNO14967 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLGNO14967 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLGNO14967 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLGNO14967 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLGNO14967 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms