Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms