Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms