Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4E171 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4E171 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4E171 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms