Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL1A6NKG5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms