Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
XIRP2A4UGR9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XIRP2A4UGR9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms