Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y698

CACNG2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG2Q9Y698 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG2Q9Y698 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms