Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF346Q9UL40 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms