Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms