Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms