Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT172Q9UG01 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms