Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms