Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms