Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MED17Q9NVC6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms