Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTG1Q9NSN8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms