Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRC4Q9NPP4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLRC4Q9NPP4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms