Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST11Q9NPF2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST11Q9NPF2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms