Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-5Q9HDB9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms