Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms